Согласно п. 50.3 ст. 50 НАЛОГОВОГО КОДЕКСА УКРАИНЫ (далее - НКУ) если налогоплательщик подает уточняющий расчет к налоговой декларации, представленной за проверяемый период, или не представляет уточняющий расчет в течение 20 рабочих дней после даты составления справки о проведении электронной проверки, которой установлено нарушение налогового законодательства, соответствующий контролирующий орган имеет право на проведение внеплановой проверки налогоплательщика за соответствующий период.
Так, согласно п 78.1.3 п. 78.1 ст. 78 НКУ представление налогоплательщиком уточняющего расчета по соответствующему налогу за период, который проверялся контролирующим органом, является основанием для проведения документальной внеплановой проверки такого плательщика.
Ограничения в основаниях проведения проверок налогоплательщиков, установленные НКУ, не распространяются на проверки, проводимые по обращению такого налогоплательщика, или проверки, проводимые в рамках уголовного производства (п. 78.2 ст. 78 НКУ).
Кроме того, обстоятельствами для проведения документальной внеплановой проверки являются, в частности:

• представление налогоплательщиком в установленном порядке контролирующему органу возражения к акту проверки или жалобы на принятое по ее результатам налоговое уведомление-решение, в которых требуется полный или частичный пересмотр результатов соответствующей проверки или отмены принятого по ее результатам налогового уведомления-решения в случае, если плательщик налогов в своей жалобе (возражениях) ссылается на обстоятельства, которые не были исследованы в ходе проверки, и объективное их рассмотрение невозможно без проведения проверки. Такая проверка проводится исключительно по вопросам, которые стали предметом обжалования (п.п. 78.1.5 п. 78.1 ст. 78 НКУ);
• контролирующим органом высшего уровня в порядке контроля за действиями или бездействием должностных лиц контролирующего органа низшего уровня осуществлена ​​проверка документов обязательной отчетности налогоплательщика или материалов документальной проверки, проведенной контролирующим органом низшего уровня, и выявлено несоответствие заключений акта проверки требованиям законодательства или неполное выяснение при проверке вопросов, которые должны быть выяснены в ходе проверки для вынесения объективного заключения о соблюдении налогоплательщиком требований законодательства, контроль за соблюдением которого возложен на контролирующие органы.

Решение о проведении документальной внеплановой проверки в этом случае принимается контролирующим органом высшего уровня лишь в том случае, если в отношении должностных лиц контролирующего органа низшего уровня, которые проводили документальную проверку указанного налогоплательщика, начато служебное расследование или им сообщено о подозрении в совершении уголовного преступления (п.п. 78.1.12 п. 78.1 ст. 78 НКУ).
Учитывая указанное, при наличии достаточных оснований, контролирующий орган имеет право проводить документальную внеплановую проверку за период, который уже проверен для определения достоверности начисления бюджетного возмещения, в том числе если подан уточняющий расчет, которым уменьшается сумма бюджетного возмещения, которая уже ему возмещена.

Отдел организации работы
Главного управления ГФС в Тернопольской области

Источник: https://uteka.ua/publication/Byudzhetnoe-vozmeshhenie-odin-period---dve-proverki