Согласно Инструкции по применению Плана счетов бухгалтерского учета активов, капитала, обязательств и хозяйственных операций предприятий и организаций, начисление компенсации из бюджета в пределах среднего заработка работников, призванных на военную службу по призыву по мобилизации, на особый период отражается в бухгалтерском учете по кредиту счета 66 "Расчеты по выплатам работникам» и дебету счета 94 "Прочие расходы операционной деятельности". Поступление денежных средств на счет предприятия от органов социальной защиты населения для выплаты компенсации отражается по дебету счета 31 «Счета в банках» и кредиту счета 48 "Целевое финансирование и целевые поступления". Одновременно на эту сумму признается доход и отражается по дебету счета 48 и кредиту счета 71 "Прочие операционные доходы". Выплата компенсации мобилизованным работникам отражается по дебету счета 66 и кредиту счета 30 "Наличность" или 31.

Письмо Минфина от 24.09.15 г. № 31-11410-08-10/29963.