Нужно ли уплачивать средства на новые счета, если с прошлого года осталась регистрационная сумма?

Нет, не нужно. Объясним подробнее.

Согласно п. 2001.3 Налогового кодекса (далее – НК) налогоплательщик имеет право зарегистрировать налоговые накладные и/или расчеты корректировки в Едином реестре налоговых накладных на сумму налога (∑Накл), исчисленную по следующей формуле:

∑Накл = ∑НаклОтр + ∑Митн + 
+ ∑ПопРах + ∑Овердрафт – ∑НаклВид – 
– ∑Відшкод – ∑Перевищ,

где, в частности, ∑ПопРах – общая сумма пополнения с текущего счета налогоплательщика счета в системе электронного администрирования налога, в том числе счетов в системе электронного администрирования НДС плательщика – сельскохозяйственного предприятия, который выбрал специальный режим налогообложения в соответствии со ст. 209 НК, указанных в пп. «а»–«в» п. 2001.2.

Какого-либо обнуления указанной суммы (регистрационного лимита) для спецрежимщиков с 01.01.16 г. не предусмотрено. В 2016 году у сельхозпредприятий появилось еще три дополнительных электронных счета в системе электронного администрирования НДС. 

Однако если на момент регистрации налоговой накладной указанный лимит превышает сумму НДС по такой налоговой накладной, то перечислять средства на дополнительные счета не нужно, даже если такая регистрационная сумма была сформирована в прошлом году.

Источник: "БАЛАНС-АГРО", 2016, № 6.

Новости по теме:
НДС-отчетность за январь 2016 года – по новой форме
С 1 февраля действуют новые формы отчетности по НДС
Новая форма налоговой накладной – с 1 апреля 2016 года